ההתפתחויות במלחמת האזרחים בסוריה מעלים חששות רבים במערכת הביטחון הישראלית, כאשר אחד החששות העיקריים הוא שהמורדים בשלטון אסד יצליחו להשתלט על נשק אסטרטגי כמו טילים מסוגים שונים, מטוסים וטנקים, נשק כימי ועוד.
בסיסי הצבא הסורי באזור חאלב, העיר השנייה בגודלה בסוריה שנפלה בימים האחרונים לידי המורדים, מכילים גם תשתיות לייצור אמצעי לחימה כמו רקטות וטילים מדוייקים, שחלקם מגיעים לידי חיזבאללה ומיליציות פרו-איראניות.
בנוסף, חלק מהמורדים משתייכים לארגונים איסלאמיסטים קיצוניים, ובמערכת הביטחון הישראלית חוששים כי אלו יפנו בשלב מסוים את נשקם לעבר ישראל.