דוח מבקר העירייה לשנת 2021 חשף התנהלות לא תקינה באגף הביטחון והחירום בעירייה, והעומד בראשו שמוליק כהן. מבקר העירייה אף המליץ כי כהן יינזף בידי מנכ"ל העירייה, אולם הצעתו נדחתה. את הדוח הציג מבקר העירייה, אריק משיח, בפני חברי המועצה בשבוע שעבר, בו עסק במספר תחומים בפעילות העירייה, מהצבת מצלמות בבתי הספר ועד להתנהלות עירוני מודיעין בפרשת קבוצת הנשים.
בחלקו של הדוח הנוגע לפעילות אגף הביטחון והעומד בראשו, חשף מבקר העירייה ליקויים נרחבים בהתנהלותו של כהן. על פי הדוח, "ניהול כוח אדם באגף לוקה בחסר, כאשר עובדים אינם משובצים בתפקידים להם נבחרו, וכתוצאה מכך לחלקם רכיבי שכר שמשתלמים להם למרות שאינם זכאים מעצם תפקידם בפועל". עוד נכתב בדוח כי "אגף הביטחון לא פעל מול משאבי אנוש להוצאת מכרזים לאיוש כלל המשרות הפנויות", וכי "נתוני העזיבה של העובדים באגף הביטחון גבוהים באופן לא סביר". עוד הוסיף משיח כי "מנהל אגף ביטחון עובד באופן ריכוזי, עובדה המונעת ממנהלי מחלקות לפעול בתחומם (אינם מנהלים את הזמנות הרכש, אינם מבצעים בקרה של תקינות ההזמנות לעומת חוזה ההתקשרות, אינם בוחנים את ההזמנות, אינם מנהלים הליכי הצעות מחיר) ופוגעת בעיקרון הפרדת התפקידים, וכתוצאה מכך נפגעות הבקרות באגף".
ברשימת ההמלצות קובע דוח המבקר כי "סמנכ"לית משאבי אנוש תפעל בתחומים הר"מ באגף הביטחון בהקדם האפשרי: הגדרת המבנה הארגוני של האגף, הגדרת נהלי עבודה באגף, הסדרת התפקידים בהם מועסקים העובדים ולהסדרת השכר והתוספות הייחודיות". כמו כן, נקבע כי סמנכ"לית משאבי האנוש תבחן את נתוני העזיבה החריגים באגף ותחליט על ההתנהלות והפעולות לטיפול הנושא. בנוסף, מנכ"ל העירייה יפעל וינחה לעיון בניהול הרכבים באגף הביטחון. כאמור, מבקר העירייה אף המליץ שכהן יינזף על "התנהלותו באגף, החל משינוי הגדרות התפקיד של עובדי האגף ללא אישור וללא מכרז, וכלה בעבודה מול ספק בניגוד לכללי מינהל תקין". דוח המבקר אף קובע כי מעתה ואילך יציג כהן בפני מנכ"ל העירייה מדיניות סדורה של עבודת הניידות במשמרות, פעילות בהרכב כוח אדם חסר, זמני תקן לטיפול בעבירות ואופן הטיפול, יחד עם קביעת לוח זמנים להכשרת פקחים בנושא איכות הסביבה. עוד נקבע כי מנכ"ל העירייה ינחה את הגזבר להידוק הבקרה על פעילות האגפים והמנהלים, וינחה את מנהלת מחלקת מכרזים לעקוב ולפעול להוצאת מכרזים בתחומים בהם הסתיימה ההתקשרות".
מדוברות העירייה נמסר: "מנהל אגף הביטחון הוא מהעובדים הטובים והמסורים בעירייה. במהלך השנים האחרונות מנהל האגף התמודד, ועדיין מתמודד, עם אתגרים לא פשוטים בשל אירועי הביטחון ברחבי העיר, כמו גם הנחיות הקורונה. אגף הביטחון ושירותי החירום, על כל עובדיו, עמד בכולן בצורה מעוררת כבוד, ולעובדי האגף יש זכויות רבות לכך שמודיעין היא מהערים הבטוחות ביותר בישראל. כבר עם תחילת עבודת מבקר העירייה על הדוח החל מנהל האגף בטיפול במסקנות, והוא ממשיך לטפל בהן במטרה שהאגף יוסיף להיות אגף מוביל ואיכותי, שעובד סביב השעון 24/7 לטובת העיר ותושביה".
כאמור, דוח המבקר בחן גם את נושא קבוצת הנשים הבוגרת של המועדון. כזכור, לפני כשנה התקבלה הבשורה כי הקבוצה לא תשחק בליגת העל, אליה העפילה בסיום העונה הקודמת. בעירייה טענו בזמנו כי החלטה זו התקבלה בידי ההתאחדות לכדורגל, למרות המאמצים שנעשו למצוא פתרון לבעיה התקציבית שנותרה לאחר העיכוב בכספי התמיכה מהטוטו. כזכור, בקבוצת הנשים עצמה, וגם בקרב חברי האופוזיציה, חזרו שוב ושוב במהלך השנה האחרונה על הטענה כי מדובר באפליית נשים. עם זאת, דוח המבקר, שבחן את התנהלות המועדון העירוני בנושא, קבע כי "גורמי המקצוע בעמותה, יו"ר העמותה, חברי העמותה, הצוות המקצועי של ענף הכדורגל וגורמי המקצוע בעירייה פעלו למיצוי כלל האפשרויות על מנת לאפשר לקבוצת הנשים לפעול בליגת העל".