לאחר פרסום תחקיר השב"כ על תפקוד הארגון וחלקו במחדל ה-7 באוקטובר, בלשכת ראש הממשלה נתניהו ניצלו את ההזדמנות לתקוף את ראש השב"כ רונן בר.
התחקיר חשף את כשלי הארגון בהפעלת מקורות אנושיים ברצועת עזה בשנים שקדמו לטבח, אולם הפנו אצבע מאשימה גם לדרג המדיני שנקט ב"מדיניות של שקט", כפי שנכתב בדוח. בלשכת רה"מ הגיבו אמש ואמרו כי "במקום לשתף פעולה עם מבקר המדינה, ראש השב"כ רונן בר מציג 'תחקיר' שלא עונה על אף שאלה. מסקנות תחקיר השב"כ לא הולמות את גודל הכשל והמחדל העצומים של הארגון והעומד בראשו".
עוד הוסיפו בלשכה כי "ראש השב"כ כשל באופן מוחלט בכל הקשור להתמודדות של הארגון נגד החמאס באופן כללי, ובאירוע 7 באוקטובר בפרט. ראש השב"כ לא קרא נכון את תמונת המודיעין והיה שבוי בקונספציה. בהערכות המודיעין השוטפות, כולל ימים בודדים לפני הטבח, התזה המרכזית בשב"כ הייתה שהחמאס מעוניין לשמור על שקט ושלא תיפתח מערכה".
